Акустоэлектроники, акустооптики и магнитоэлектроники (фрязинский филиал):
темгруппа нелинейных акустических явлений в конденсированных средах;
лаборатория исследований физических явлений на поверхности и границах раздела твердых тел;
темгруппа магнитооптики;
лаборатория физических проблем спинволновой электроники;
лаборатория акустооптических методов обработки информации;
лаборатория акустомагнитных явлений;
лаборатория быстропротекающих оптических явлений в твердотельных структурах;
лаборатория исследования СВЧ свойств ферромагнитных атериалов;
лаборатория термофотоакустики.Биомедицинских диагностических систем:
лаборатория биомедицинской радиоэлектроники;
лаборатория методов применения ЭВМ в научных исследованиях.Информатики:
лаборатория математических методов радиофизики;
лаборатория многоканальных исследований природных объектов (фрязинский филиал);
лаборатория вычислительная (фрязинский филиал).Квантовой радиофизики:
лаборатория квантово-механических усилителей и генераторов;
лаборатория плазмохимического синтеза оптических структур;
лаборатория молекулярной наноэлектроники (фрязинский филиал) ;
лаборатория волоконных световодов и элементов на их основе (фрязинский филиал);
лаборатория исследования материалов для квантовой электроники (фрязинский филиал);
лаборатория стабилизации и измерения частоты.Космической радиофизики (фрязинский филиал):
лаборатория исследований космической плазмы радиофизическими методами;
лаборатория распространения радиоволн в космосе;
лаборатория радиофизических методов зондирования атмосфер планет;
лаборатория распространения радиоволн и дистанционного зондирования.Метрики и оконечных устройств волоконно-оптических систем (фрязинский филиал):
лаборатория элементов систем лазерной связи;
лаборатория радиофизических измерений.Микроэлектроники (фрязинский филиал):
лаборатория спинволновых процессов в миллиметровом и субмиллиметровом диапазонах длин волн;
лаборатория функциональной электроники;
лаборатория теоретических проблем микроэлектроники.Монокристаллических материалов (фрязинский филиал):
лаборатория проблем субмикронной технологии;
лаборатория технологических процессов твердотельной электроники;
лаборатория полупроводниковых кристаллов и пленок;
лаборатория химических методов технологии и анализа;
лаборатория лазерных материалов и ферритов.Полупроводниковой электроники:
лаборатория полупроводниковых приборов;
лаборатория электронных процессов в полупроводниковых приборах;
лаборатория микро- и наноэлектроники.Радиофизики и электроники миллиметрового диапазона волн (фрязинский филиал):
лаборатория твердотельной электроники миллиметрового дапазона;
лаборатория проблем СВЧ кинетики горячих электронов в полупроводниковых приборах;
лаборатория зондирования природных и искусственных объектов в ММ диапазоне длин волн;
лаборатория перспективных материалов и технологий для высокочастотной электроники.Статистической радиофизики:
лаборатория информационных технологий на основе принципов динамического хаоса и тавердотельной функциональной электроники;
лаборатория проблем рассеяния СВЧ сигналов в неоднородных средах.Физических основ наноэлектроники:
лаборатория исследования свойств магнитных и оптических микро- и наноструктур;
лаборатория физических основ нанокомпозитных материалов для информационных технологий;
лаборатория низкоразмерных структур атомного масштаба.Физической электроники:
лаборатория электронных процессов в тонких пленках и пленочных структурах;
лаборатория эмиссионной электроники;
лаборатория фотоэлектронных явлений;
лаборатория низкоразмерных наноструктур;
лаборатория теоретических проблем физической электроники (на английском).ЦОКХИ (Центр обработки и хранения космической информации) (Фрязинский филиал):
лаборатория инструментальных и информационных методов исследования окружающей среды средствами дистанционного зондирования;
лаборатория радиолокационных методов дистанционного зондирования;
лаборатория методов информатизации дистанционного зондирования.Электродинамики искусственных сред и структур (Фрязинский филиал):
лаборатория проблем дифракции;
лаборатория метрики миллиметровых и субмиллиметровых волн;
лаборатория оптических и волноводных систем.Электроники СВЧ:
лаборатория электронно-плазменных приборов СВЧ (Фрязинский филиал);
лаборатория разработки технологии СВЧ приборов (Фрязинский филиал);
лаборатория радиофизических свойств плазмы (Фрязинский филиал).Лаборатория магнитных явлений в микроэлектронике
Лаборатория оптико-механических свойств материалов
Лаборатория радиофизических методов в аэрокосмических исследованиях природно-техногенной среды
Лаборатория физических основ функциональной тонкоплёночной оксидной электроники (на английском)
Лаборатория сверхпроводниковых устройств для приема и обработки информации (на английском)Лаборатория сверхпроводниковых элементов и систем обработки сигналов на их основе (на английском)
Лаборатория устройств молекулярной и биологической электроники
Лаборатория электродинамики композиционных сред и структур
Лаборатория волновой электроники (фрязинский филиал).Лаборатория статистики помех (фрязинский филиал)
Темгруппа радиолокации малых тел Солнечной системы (фрязинский филиал)
